數控平面鉆鉆薄板時，要將工件加固，鉆大型工件時，請工件的穩固。在鉆孔開始與結束時，進給量應降低1/3。對鉆削時出現大量細小粉未的材料，如鑄鐵、鑄銅等，可以不使用冷卻液，而采用壓縮空氣幫助排屑。當然還要及時清除纏繞在鉆體上的鐵屑，以排屑順暢。

關于數控平面鉆的清潔也是有要求的，擦拭鉆臺，床身、導軌，絲桿及操作手柄，保持床身及周邊清潔，無油污；清除導軌面毛刺及絲桿鉆渣雜質；拆卸清洗油毛氈；去除鉆床各部銹跡，保護噴漆面。

安裝數控平面鉆鉆頭的時候，先是緩慢起吊鉆頭盒體，將鉆頭盒體的四個支腿對應放入鉆機轉盤的四個孔內，根據鉆頭的規格選用相應的鉆頭盒芯板，起吊鉆頭盒芯板放入鉆頭盒體內然后將要安裝的鉆頭凹槽與鉆頭盒芯板的凸尖對應，將鉆頭放入鉆頭盒內，鉆頭即卡放在轉盤心，然后依次旋上鉆頭連接螺母鉆桿。

拆卸數控平面鉆鉆頭的方法也很簡單，起吊鉆桿，將鉆頭盒體與轉盤連接，起吊鉆桿緩慢使鉆頭凹槽與鉆頭盒芯板的凸尖對應，將鉆頭卡在鉆頭盒內，依次退去鉆桿、鉆頭。